Usar redes para diseñar circuitos genéticos

A medida que los circuitos se vuelven más sofisticados, el tamaño y la complejidad de los datos sobre el diseño incrementan. Estos datos van mucho más allá de meras secuencias de AND; información sobre la modularidad de los circuitos y detalles funcionales mejoran la comprensión, el análisis de las construcciones. Sin embargo, esta información añade nuevos retos a la accesibilidad, visualización y usabilidad de los diseños (datos y metadatos). Presentamos un método para convertir diseños de circuitos en redes, y mostramos el potencial para mejorar la utilidad del diseño. Dado que las redes y los grafos son estructuras dinámicas, estas pueden ser moldeadas de forma interactiva para resaltar la información que se considere relevante, como la jerarquía en el diseño o la regulación genética. Además, varios cambios visuales pueden ser aplicados (como colores, o agrupación de nodos) que mejoren la comprensión y visualización de los diseños. Este enfoque también permite a dos redes (dos diseños) interactuar. Abogamos por la utilización de redes y teoría de grafos para representar y utilizar la información derivada de diseños de biología sintética.