PhyloCloud: una plataforma cloud para visualizar y interpretar los datos filogenómicos

Los datos filogenómicos han crecido exponencialmente en las últimas décadas. Actualmente, los proyectos generen cientos o incluso miles de de árboles filogenéticos y múltiples alineaciones de secuencias, que también pueden tener un tamaño muy grande.Sin embargo, el análisis y la interpretación de dichos datos todavía dependen de flujos de trabajo bioinformáticos y de visualización personalizados que son en gran medida inalcanzables para usuarios sin experiencia en programación. Aquí, presentamos PhyloCloud, una plataforma cloud destinada a alojar, indexar y explorar grandes colecciones de árboles filogenéticos, que también brinda acceso sin problemas a análisis y operaciones comunes, como anotación de nodos, búsqueda, edición de topología, enraizamiento automático de árboles, detección de ortología y más. PhyloCloud ofrece un novedoso sistema de visualización de árboles en ETE Toolkit v4.0, que se puede usar para explorar árboles muy grandes y mejorarlos con anotaciones personalizadas y múltiples alineaciones de secuencias. La plataforma permite compartir colecciones de árboles y vistas de árboles específicos a través de enlaces privados, o hacerlos totalmente públicos, sirviendo también como depósito de datos filogenómicos. PhyloCloud está disponible en https://phylocloud.cgmlab.org