El nitrato es un nutriente esencial y a la vez una molécula señalizadora muy potente que modula múltiples aspectos del crecimiento y del desarrollo de las plantas, y especialmente el de la raíz. Sin embargo, los mecanismos y los genes que controlan las respuestas a nitrato en los distintos tipos celulares de la raíz son poco conocidos.
Para comprender los eventos de señalización que ocurren a nivel celular en respuesta al nitrato en la raíz, en este trabajo, se han analizado cambios en el transcriptoma en distintos tipos celulares de la raíz: epidermis, cortex, endodermis, periciclo y estela, a distintos tiempos después de un tratamiento con nitrato. Los resultados obtenidos en este trabajo indican que los genes que responden a nitrato y los procesos biológicos implicados se regulan coordinadamente en el tiempo, y se inician en las capas de tejido más externas y se propagan a las capas de tejido más internas de la raíz. Ademas, la integración de los datos obtenidos con datos disponibles de interacción factor transcripcional-DNA ha permitido establecer un nuevo modelo de regulación genética en el que la endodermis se encuentra como un centro regulador principal de las respuestas a nitrato y se ha identificado los factores de transcripción ABF2 y ABF3, relacionados con las respuestas a ABA, como reguladores clave de las respuestas endodérmicas a nitrato.
Este trabajo ofrece una resolución espacio-temporal sin precedentes de la respuesta de la raíz al nitrato e identifica nuevos componentes implicados en las respuestas de la raíz este nutriente.