Análisis computacionales desvelan aminoácidos clave de proteínas presentadoras de antígenos en el reconocimiento de alérgenos

El reconocimiento molecular que desencadena la respuesta alérgica comienza con la carga de moléculas en proteínas que presentan antígenos a receptores de células T. CD1d es la proteína que presenta lípidos a las células iNKT. Nuestro trabajo computacional ha identificado aminoácidos de CD1d con un papel potencialmente crucial en esa carga inicial.

 

Se puede considerar la alergia como una respuesta exacerbada del sistema inmune a la presencia de compuestos normalmente inofensivos (alérgenos). En el caso de los alérgenos de origen vegetal que constituyen el objeto de nuestra investigación, crece la evidencia de que muchos de los compuestos alergénicos son lípidos o moléculas con segmentos lipídicos. Las proteínas que presentan antígenos a los receptores de las células T son esenciales en las primeras fases de un proceso que desencadena la cascada de eventos moleculares asociados a las respuestas inmunitarias. Entre esas proteínas, CD1d (uno de los 5 isotipos de proteínas CD1 en humanos) es la responsable de presentar antígenos lipídicos. En este artículo presentamos la segunda parte de nuestro estudio estructural de CD1d, cuya primera parte se ha publicado recientemente (ver Noticias CBGP del 7 Abril 2020). Nuestro análisis computacional ha desvelado tres triptófanos presentes sólo en CD1d entre todas las proteínas CD1, que podrían desempeñar un papel crucial en la carga y transporte de moléculas lipídicas en distintos compartimentos celulares. Esos tres aminoácidos están completamente expuestos al medio acuoso y participan en la flexibilidad y en la actividad dependiente del pH de la proteína CD1d.

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Publicación Original:

Cuevas-Zuviría, B., Mínguez-Toral, M., Díaz-Perales, A., Garrido-Arandia, M., Pacios, L.F. 2020. Structural Dynamics of the Lipid Antigen-Binding Site of CD1d Protein. Biomolecules 10, 532. DOI: 10.3390/biom10040532


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