El método más eficaz para su control es la aplicación de fungicidas, y ello conlleva asociados problemas medioambientales o para la salud humana, lo que ha llevado a buscar otras alternativas como es el uso de agentes de control biológico.

En este artículo, derivado de la colaboración del grupo de la Dra. María A. Ayllón del CBGP (UPM-INIA) con el Dr. Davide Pacifico (Institute of Bioscience and Bioresources, National Research Council of Italy), dentro del proyecto europeo H2020 VIROPLANT (Virome NGS analysis of pests and pathogens for plant protection, H2020-SFS-17) , se ha hecho un exhaustivo análisis del micoviroma de B. cinerea. El resultado del proyecto ha permitido obtener una colección de micovirus con todo tipo de genomas, de RNA de doble (dsRNA) y simple cadena (ssRNA) (positiva y negativa) y de simple cadena de DNA (ssDNA). La mayoría de estos micovirus han sido descubiertos en este trabajo, y otros ya se habían encontrado infectando a B. cinerea o a otros hongos patógenos de plantas. Algunos de estos micovirus pertenecen a géneros que se sabe que producen hipovirulencia en sus hongos huéspedes y podrían ser prometedores agentes de control biológico de este hongo. Entre los micovirus caracterizados destacan uno con genoma de ssRNA- trisegmentado y otro con genoma de ssDNA, pero lo más destacable ha sido la descripción de cuatro nuevos virus con genoma bisegmentado (binarnavirus) que no habían sido descritos previamente en la naturaleza. Actualmente, se está trabajando con varios de estos micovirus para demostrar la inducción de hipovirulencia en el hongo y poder usarlos en el futuro como agentes de control biológico.