Las plantas sufren diferentes estreses, tanto abióticos como bióticos, que disparan su maquinaria molecular para combatirlos. Además de mecanismos generales activados por muchos estreses, existen mecanismos específicos difíciles de identificar para optimizar la respuesta a cada estrés. Para identificar estos mecanismos, en este artículo se combina un extenso análisis transcriptómico de la respuesta de una planta a una plaga con un meta-análisis de las respuestas de esa planta a plagas relacionadas. Como plaga se utilizó la araña roja Tetranychus urticae, como plagas relacionadas otras especies de artrópodos herbívoros, y como planta Arabidopsis thaliana. El análisis de los datos transcriptómicos identificó respuestas típicas de la planta a las plagas, como la biosíntesis de glucosinolatos y la señalización por jasmonato, junto a un conjunto de genes específicos de la respuesta de Arabidopsis a la araña roja. Estos hallazgos permiten atribuir un papel destacado de las rutas de biosíntesis de antocianinas y tocoferoles inducidas por jasmonato en la interacción Arabidopsis-araña roja. Por tanto, la combinación de análisis transcriptómicos individuales con meta-análisis se ha revelado como un método efectivo para la identificación de procesos relevantes y especificidades en la respuesta de la planta a estreses ambientales.