Ejecutando servicios SADI en Galaxy
A medida que las investigaciones biológicas van requiriendo un uso intensivo de datos, hay una creciente necesidad de procesos de análisis de datos mas automatizados, reproducibles y con menor tasa de error. En las Ciencias de la Vida (entre otras áreas de la investigación), la elección tecnológica mas popular para llevar a cabo estos objetivos es el flujo de trabajo científico (Scientific Workflow). Entre una gran variedad de herramientas de software capaces de crear, manejar y ejecutar workflows, Galaxy es una de las más populares. SADI es una manera computacionalmente explicita de publicar herramientas analíticas y datos en la Web, permitiendo a éstas descubrir, acceder automáticamente y concatenar recuperación de datos y procesos de análisis. En este artículo, describimos la intersección de Galaxy y las tecnologías SADI, donde la recuperación de datos y las herramientas de análisis SADI pueden ser añadidas fácilmente en workflows de Galaxy. Se trata de un logro importante, ya que SADI actualmente está siendo usado para publicar 23,000 servicios bioinformaticos, que ahora pueden ser accesibles de manera sencilla a través de Galaxy.
Publicación Original:
Egana Aranguren, M; Rodriguez Gonzalez, A; Wilkinson, MD. 2014. "Executing SADI services in Galaxy". Journal of Biomedical Semantics. DOI: 10.1186/2041-1480-5-42".