La regulación transcripcional de genes específicos es un paso clave en la respuesta de las plantas a factores medioambientales y de desarrollo. Un conocimiento profundo de cómo se regulan los procesos biológicos en los organismos vegetales requiere desvelar los mecanismos moleculares que controlan la expresión génica. En este trabajo describimos una técnica robusta para la identificación de los sitios de unión a DNA de proteínas de Arabidopsis mediante inmunoprecipitación de cromatina (ChIP). Este método se ha mostrado útil en la caracterización de factores de transcripción, proteínas relacionadas con la cromatina e histonas modificadas post-traduccionalmente.