Alternaria es un género de hongos comunes que invaden cosechas y que están también asociados con alergias respiratorias y asma crónica. Alt a 1 es el alérgeno principal de Alternaria alternata, el miembro más importante y uno de los hongos más extendidos.

Alt a 1 es una proteína peculiar en muchos sentidos. Su estructura cristalográfica revela un plegamiento único sin equivalente topológico en el Protein Data Bank. Sólo la forma tetramérica une ligandos tipo flavonoide (quercetina en particular) con alta afinidad. El dímero es una estructura muy simétrica con epítopos localizados de forma apropiada para el entrecruzamiento de IgE. La función de Alt a 1 en Alternaria se desconoce pero nuestros resultados sugieren que los distintos oligómeros y la presencia de un ligando flavonoide hacen que la proteína desempeñe papeles diferentes dependiendo de su localización fisiológica. Tanto los estados de agregación como las propiedades de unión a ligandos resultan depender del pH del medio.

Un estudio computacional combinando métodos que van desde cálculos de docking hasta simulaciones de Dinámica Molecular nos ha permitido explicar las notables características de esta proteína altamente alergénica y elaborar una primera imagen de sus posibles interacciones fisiológicas.