El que la inducción de la floración ocurra en el momento adecuado es un factor clave para el éxito reproductivo de las plantas. La percepción de la longitud del día permite a las plantas sincronizar la floración con los cambios estacionales. Datos recientes indican que, además de la regulación transcripcional, la inducción de la floración en respuesta al fotoperiodo también está regulada por la modulación de la estabilidad y la degradación de las proteínas. Por ello, el sistema ubiquitina/ proteosoma 26S para la degradación de proteínas señalizadas ha emergido como un elemento clave de la regulación fotoperiódica de la floración. En esta revisión, hemos descrito el conocimiento actual que se tiene sobre diferentes E3 ubiquitina ligasas que señalizan proteínas involucradas en la percepción de la longitud del día, tales como fotoreceptores y componentes del reloj circadiano, o que están implicadas en la respuesta de la floración al fotoperiodo, tales como elementos que median la inducción de la floración en respuesta a condiciones fotoperiódicas de día largo. Además, hemos discutido los avances más recientes en la identificación de los homólogos de estas E3 ubiquitina ligasas de Arabidopsis descritas en otras especies de plantas. La figura emergente revela una red compleja de interacciones con un papel esencial para la degradación de proteínas señalizadas mediada por ubiquitina en la regulación de la floración dependiente de fotoperiodo. Dada la gran variedad de complejos ubiquitina ligasas de plantas, es probable que nuevos factores involucrados en los mecanismos de degradación de proteínas señalizadas sean pronto adscritos a varios aspectos del control del tiempo de floración.