OPPL-GALAXY, una herramienta Galaxy para mejorar la explotación de ontologías como parte de flujos de trabajo en bioinformática


OPPL (Ontology Pre-Processor Language) es una herramienta que facilita el enriquecimiento e integración de ontologías biológicas ya existentes, de tal manera que puedan ser aplicadas a nuevas situaciones y objetivos. OPPL Galaxy permite manipular las ontologías directamente en los entornos donde biólogos de alto rendimiento ya han ejecutado sus análisis - en Galaxy, el popular entorno de modelado de flujos de trabajo. La vinculación de OPPL-Galaxy con otras herramientas bioinformáticas del entorno Galaxy da como resultado un sistema que es más que la suma de sus partes. OPPL-Galaxy abre una nueva dimensión en el análisis y explotación de ontologías biológicas, incluyendo razonamiento automático y pavimentando el camino hacia análisis de datos biológicos más avanzados.



Publicación Original:

Egaña Aranguren, M; Fernández-Breis, JT; Antezana, E; Mungall, C; Rodríguez González, A; Wilkinson, MD. 2013. "OPPL-Galaxy, a Galaxy tool for enhancing ontology exploitation as part of bioinformatics workflows". Journal of Biomedical Semantics. DOI: 2041-1480-4-2 [pii] 10.1186/2041-1480-4-2".

 

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