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Mark Wilkinson obtiene el Premio al Mejor Artículo en la “International Academy, Research, and Industry Association's Service Computation 2013 Conference”, una conferencia con revisión por pares

El artículo expone cómo las tecnologías desarrolladas en el laboratorio del Dr. Wilkinson van a ayudar a los investigadores a automatizar el análisis de la gran cantidad de datos producidas por las actuales herramientas biológicas de alto rendimiento.

Con la disminución del precio de los análisis biológicos de alto rendimiento, se ha generado un vacío entre la cantidad de datos que se pueden producir por parte de los investigadores en Biología (incluso en laboratorios pequeños), y su experiencia en el manejo y análisis estadístico de datos a gran escala. Como resultado, en un mundo colonizado por el concepto “grandes datos” (“big-data”), existen evidencias de que la investigación biomédica está en crisis. Se ha publicado recientemente que más del 50% de los experimentos publicados mediante revisión por pares no pueden ser reproducidos, en ocasiones ni siquiera usando el mismo conjunto inicial de datos. Esto revela que en muchos casos, no solo es que los investigadores sean incapaces de analizar de forma correcta sus propios datos o informar de forma eficiente sobre cómo hicieron el análisis, sino que el sistema primario y nuclear sobre el que se basa la ciencia (la revisión por pares) está fallando dentro del mundo "grandes datos". Existen otros síntomas de esta crisis, incluyendo el fenómeno conocido como “deriva de una aseveración” ("assertion-drift") donde un investigador cita el trabajo de otro pero cambiándolo ligeramente, lo que da lugar a un cambio gradual a lo largo de los años en la interpretación de observaciones biológicas clave, incluso aunque no haya evidencias. Finalmente, está el surgimiento de la Web como una de las herramientas fundamentales para la exploración y compartición de resultados de la investigación biológica de forma casi inmediata, haciendo esos errores aún más problemáticos debido a la velocidad a la que se diseminan y utilizan.

En este artículo se discute cómo varias tecnologías creadas en el laboratorio del Dr. Mark Wilkinson van a ayudar a los investigadores a automatizar el análisis de su "grandes datos" mediante el uso de técnicas y metodologías usadas por expertos altamente capacitados como estadísticos y bioinformáticos de todo el mundo. Estos enfoques analíticos se ajustan automáticamente por los ordenadores de los investigadores, resultando en un producto analítico personalizado que, sin embargo, sigue reglas y guías creadas por expertos de forma global. Este análisis no se ejecuta simplemente "tocando un boton" sino que también crea un perfecto registro de todo lo que se hace durante el mismo, permitiendo tanto a los investigadores como a los revisores saber exactamente los tipos y formas de análisis llevados a cabo. Además, el proceso analítico completo es reutilizable y se puede compartir como un fichero ejecutable con otros investigadores que estén realizando el mismo tipo de estudio. El artículo también expone cómo se van a diseñar y evaluar las herramientas que harán de éste un proceso simple y útil para los investigadores en el área de la biología, y cómo estas tecnologías se alinean dando soporte otras iniciativas globales relacionadas con el área de las publicaciones científicas como NanoPublications.

El articulo presentado por Mark Wilkinson obtuvo el Premio al Mejor Artículo, revisado por pares científicos, en la “International Academy, Research, and Industry Association's Service Computation 2013 Conference” en Valencia, España (27/mayo-1/junio 2013), bajo los criterios de calidad del manuscrito final, los comentarios de los evaluadores y la calidad de la plataforma utilizada en la presentación en la conferencia.

 

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