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Un mejor diseño de circuitos genéticos mediante el uso de interacciones circuito-organismo

Aunque el diseño de redes sintéticas se basa fundamentalmente en componentes de ADN (genes, promotores, terminadores…), lo que rodea a la secuencia de ADN-el contexto-en el que ejecutan es vital para predecir su comportamiento. La predictibilidad de estas redes, o circuitos, es uno de los principales retos en biología sintética. Sin embargo, las interacciones entre el circuito y el contexto del organismo que lo alberga, se suelen ignorar. Aquí, usamos una librería de 20 inversores genéticos para diseñar dependencias de contexto. Como resultado, los 20 inversores dan 135 funciones distintas (en lugar de 20), solamente debido al cambio de esas dependencias y dejando la secuencia intacta. Esto implica que el diseño de circuitos no debe estar únicamente basado en la secuencia de ADN, y adoptar un enfoque más amplio que incorpore otras características celulares. Esto puede resultar en una mejora substancial en el campo de la biología sintética.

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Publicación Original:

Tas, H., Grozinger, L., Stoof, R., de Lorenzo, V., Goñi-Moreno, Á. 2021. Contextual dependencies expand the re-usability of genetic inverters. Nature Communications 12, 355. DOI: 10.1038/s41467-020-20656-5

 

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