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NG-meta-profiler: Una herramienta bioinformática para el estudio funcional de muestras metagenómicas

La metagenómica consiste en el estudio de comunidades microbianas complejas por medio de la secuenciación de los genomas de los organismos que las componen. Las muestras pueden proceder de diferentes ecosistemas, tales como el tracto intestinal, el suelo u océanos. La herramienta bioinformática NGLess-profiler, permite procesar datos de secuenciación masiva obtenidos de dichas comunidades, y generar, de forma rápida y sencilla, perfiles de abundancia tanto de los organismos presentes en cada muestra, como de las funciones biológicas presentes en sus genomas.

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Publicación Original:

Coelho, L.P., Alves, R., Monteiro, P., Huerta-Cepas, J., Freitas, A.T., Bork, P. 2019. NG-meta-profiler: fast processing of metagenomes using NGLess, a domain-specific language. Microbiome 7, 84. DOI: 10.1186/s40168-019-0684-8

 

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